Dünya değişti. Dünya liderlerinin uzaylı güçlere koşulsuz teslimiyet teklif etmesinden bu yana yirmi yıl geçti. Gezegenin son savunma hattı olan XCOM, yok edildi ve dağıtıldı. Şimdi, XCOM 2'de uzaylılar Dünya'yı yönetiyor, yüzeyde insanlık için parlak bir gelecek vaat eden ışıldayan şehirler inşa ediyor, aynı zamanda uğursuz bir gündemi gizliyor ve yeni düzenlerine karşı çıkan herkesi ortadan kaldırıyor. Sadece dünyanın uçlarında yaşayanlar özgürlük payına sahiptir. Burada, insanlık için ayağ...